Նիկոլ Փաշինյանի կառավարությունը և Հայ Առաքելական Եկեղեցին (ՀԱԵ) երբեք դաշնակիցներ չեն եղել։ Վարչապետը քննադատել է եկեղեցու առաջնորդներին նախորդ կառավարության հետ ունեցած կապերի համար, որը նա անվանել է «հանցավոր ռեժիմ»։ Մինչդեռ եկեղեցին կասկածանքով էր նայում նրա երիտասարդ թիմին, որն ուներ արևմտամետ ՀԿ-ների հետ աշխատելու փորձ։ Գրում է BBC-ին՝ անդրադառնալով Հայաստանում տեղի ունեցող իրադարձություններին։
44-օրյա պատերազմում կրած պարտությունից հետո Ամենայն հայոց կաթողիկոս Գարեգին II-ը կոչ արեց Փաշինյանի հրաժարականը, և հարաբերությունները վերջնականապես վատացան։ Սակայն աշխարհիկ և հոգևոր իշխանությունները սովորեցին համակեցություն պահպանել և ինչ-որ կերպ հաշտվեցին միմյանց հետ՝ մինչև անցյալ շաբաթ, երբ վարչապետը կոչ արեց եկեղեցու ղեկավարի հրաժարականը։
Վերջին ուսումնասիրությունները ցույց են տալիս, որ Հայ Առաքելական Եկեղեցուն, որին պատկանում է հայերի մեծամասնությունը, ավելի շատ են վստահում, քան կառավարությանը։
Այժմ Փաշինյանի և Կաթողիկոսի միջև հակամարտությունը սպառնում է ավելի պառակտել հայ հասարակությունը, ազդել հաջորդ տարի կայանալիք ընտրությունների արդյունքների վրա և բացասաբար ազդել Ադրբեջանի հետ խաղաղության բանակցությունների վրա, ինչը կազդի ամբողջ տարածաշրջանի վրա։
